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O impacto combinado de infecções persistentes e variação genética humana em C

Nov 25, 2023

BMC Medicine volume 20, número do artigo: 416 (2022) Citar este artigo

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Detalhes das métricas

Vários patógenos humanos estabelecem infecções crônicas, às vezes para toda a vida. Mesmo que sejam frequentemente latentes, estas infecções podem desencadear algum grau de resposta imunitária local ou sistémica, resultando em inflamação crónica de baixo grau. Continua a existir uma compreensão incompleta da contribuição potencial tanto das infecções persistentes como da variação genética humana na inflamação crónica de baixo grau. Procuramos associações potenciais entre a soropositividade para 13 patógenos persistentes e os níveis plasmáticos do biomarcador inflamatório proteína C reativa (PCR), usando dados coletados no contexto do UK Biobank e do CoLaus|PsyCoLaus Study, duas grandes coortes de base populacional. . Realizamos regressão stepwise regressiva começando com os seguintes preditores potenciais: status sorológico para cada patógeno, escore de risco poligênico para PCR e fatores demográficos e clínicos conhecidos por estarem associados à PCR. Encontramos evidências de uma associação entre soropositividade para Chlamydia trachomatis (valor P = 5,04e - 3) e Helicobacter pylori (valor P = 8,63e - 4) e níveis plasmáticos mais elevados de PCR. Também encontramos uma associação entre a carga de patógenos e os níveis de PCR (valor P = 4,12e - 4). Estes resultados melhoram a nossa compreensão da relação entre infecções persistentes e inflamação crónica, um importante determinante da morbilidade a longo prazo em humanos.

Relatórios de revisão por pares

A inflamação é uma resposta complexa e necessária do sistema imunológico a estímulos prejudiciais, como lesão tecidual, infecção ou exposição a toxinas [1]. Durante a fase aguda, caracterizada por alterações no fluxo sanguíneo e aumento da permeabilidade dos vasos sanguíneos, as proteínas plasmáticas e os leucócitos migram da circulação para o local da inflamação [2]. Esta resposta protetora imediata geralmente permite a eliminação da causa inicial da lesão celular e a restauração da homeostase. No entanto, quando a resposta aguda não consegue eliminar o dano tecidual, por exemplo, devido à exposição prolongada a estímulos, a inflamação pode tornar-se um processo crônico [3]. Uma série de doenças comuns são, pelo menos parcialmente, causadas por inflamação crônica, incluindo doença arterial coronariana, diabetes tipo 2 e alguns tipos de câncer [4]. Assim, embora a inflamação desempenhe um papel importante na defesa humana contra a agressão, ela também contribui para a fisiopatologia de múltiplas doenças de grande importância para a saúde pública.

Diagnostic tests are capable of detecting the presence and intensity of systemic inflammation [5]. The most commonly used inflammatory biomarker is the acute-phase reactant C-reactive protein (CRP). This ring-shaped protein is produced by hepatocytes upon stimulation by pro-inflammatory cytokines such as interleukin (IL)-1b, IL-6, and TNF-a. Although CRP is commonly used as a sensitive indicator of inflammation, the factors influencing its baseline plasma levels are only partially understood. Circulating amounts of CRP are positively associated with age, body mass index (BMI), and smoking and inversely with male sex and physical activity [6,7,8]. In addition, large-scale genomic analyses have found multiple associations with hs-CRP levels, mainly in the loci enriched in hepatic, immune, and metabolic pathways, such as CRP, LEPR, IL6R, GCKR, APOE, and HNF1A-AS1 [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e546">9, 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e546_1"> 10,11,12,13,14]. Ao todo, a variação genética explica até 16% da variação nos níveis plasmáticos de PCR [14].

We carried out a polygenic risk score (PRS) analysis to investigate the relationship between human genetic variation and hs-CRP levels. A CRP-PRS was calculated for each study participant based on the risk effects of common SNPs derived from GWAS summary statistics of hs-CRP. As a baseline cohort, we referred to the GWAS summary statistics of the CHARGE cohort (N = 204,402, heritability h2 = 6.5%) [ 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e675"10, 27]. These summary statistics were used to construct the CRP-PRS in our target cohort consisting of the merged UK Biobank and CoLaus|PsyCoLaus data using the clumping and thresholding method of the PRSice-2 v2.2.7 software [28]. We used a standardized method to obtain PRS, by multiplying the dosage of risk alleles for each variant by the effect size in the GWAS and summing the scores across all of the selected variants. SNPs were clumped based on linkage disequilibrium (LD) (r2 ≥ 0.1) within a 250-kb window. Model estimates of the PRS effect were adjusted for sex, age, BMI, and the top 10 PCs. As an additional quality control, the distribution of PRS was checked in each cohort separately, to ensure that they followed a normal distribution./p>

We first investigated the relationship between common genetic variation and hs-CRP levels by calculating a PRS for all study participants. The PRS explained about 4% of the variation in hs-CRP levels, in agreement with previously published results [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e1261"9]. We also found that BMI was the major non-genetic predictor of hs-CRP, with approximately 19% of the variance explained./p> 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8./p> 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706./p>